一、 试剂盒概述与原理
产品名称: E.Z.N.A.® Cycle-Pure Kit
货号: D6492
用途: 用于快速纯化PCR、酶切、标记等反应后的DNA产物,去除引物、引物二聚体、dNTPs、盐离子、酶等杂质。
原理: 基于 硅胶柱(HiBind® DNA Mini Column) 技术。在高盐条件下,DNA会特异性地吸附到硅胶膜上,而杂质则被洗脱。随后在低盐缓冲液中将纯净的DNA洗脱下来。
特点:
快速: 整个过程可在15-20分钟内完成。
高效: 对100bp至10kb的DNA片段回收率高。
高纯度: 纯化后的DNA可直接用于测序、克隆、酶切、连接等下游实验。
二、 试剂盒组成(以D6492-01为例,100次预装)
请在使用前核对以下试剂是否齐全且充足:
1. CP Buffer: 结合缓冲液(含高浓度离液盐)。
2. DNA Wash Buffer(浓缩液): 漂洗液,使用前必须按说明书要求加入无水乙醇进行稀释(通常是在整瓶中加入指定体积的无水乙醇)。
3. Elution Buffer: 洗脱液(10 mM Tris-HCl, pH 8.5)。也可使用无菌去离子水(pH > 7.0)代替,但用Elution Buffer洗脱效率通常更高。
4. HiBind® DNA Mini Columns: 吸附柱(2 mL)及收集管(2 mL)。
5. 说明书。
三、 标准操作流程
实验前准备:
将DNA Wash Buffer按说明书要求用无水乙醇稀释。
将CP Buffer和Elution Buffer置于室温融化。
准备好无水乙醇。
第一步:平衡结合条件
1. 向您的PCR反应液中加入5倍体积的CP Buffer(例如,50μL PCR产物 + 250μL CP Buffer)。
2. 用移液器充分吹打混匀。
第二步:DNA结合
1. 将混合物全部转移到HiBind® DNA Mini Column中(柱子装在2mL收集管内)。
2. 室温(15-25°C),≥10,000 x g 离心 30-60秒。
3. 弃去收集管中的滤液,将柱子放回同一收集管中。
第三步:漂洗
1. 向柱子中加入 700μL DNA Wash Buffer(已含乙醇!)。
2. 室温,≥10,000 x g 离心 30-60秒。
3. 弃滤液,将柱子放回收集管。
4. 重复步骤1-3一次(即总共用Wash Buffer漂洗两次)。
5. 空离以cedi去除残留乙醇: 将空柱以最大转速(≥13,000 x g)离心 2分钟。这一步至关重要,因为残留的乙醇会严重影响下游酶促反应。
第四步:洗脱DNA
1. 将柱子转移到一个新的、干净的 1.5mL 离心管中。
2. 向柱子硅胶膜的正中央,悬空滴加 15-30μL Elution Buffer(或无菌水)。
3. 室温静置 2-5分钟,使缓冲液充分浸润膜。
4. 室温,≥10,000 x g 离心 1分钟。离心管底部的液体即为您纯化后的DNA。
5. (可选,用于提高得率) 将离心得到的洗脱液重新加回柱子吸附膜中央,再次离心1分钟。
四、 关键要点与经验总结
1. 比例是关键: “PCR产物:CP Buffer = 1:5" 这个比例必须遵守。这是保证DNA高效结合到柱上的前提。如果产物体积很小,可以先用无菌水补足到一定体积(如50μL)再加CP Buffer。
2. 乙醇是必须的: 使用前务必确认 DNA Wash Buffer 已加入正确量的无水乙醇。未加乙醇的Wash Buffer无法有效去除盐分。
3. cedi去除乙醇: 最后的 “空离2分钟" 步骤绝对不能省略。残留的乙醇会抑制后续的酶(如连接酶、测序酶等)活性。离心后可以打开柱子盖,在室温下再放置几分钟让残余乙醇wanquan挥发。
4. 提高洗脱效率:
预热Elution Buffer: 将洗脱液预热至65°C或更高温度,可以显著提高DNA的洗脱效率,从而提高最终得率。
洗脱体积: 洗脱体积越小,浓度越高,但总得率可能会略有下降。根据下游应用需求平衡。对于测序,通常用15-20μL洗脱;对于需要高浓度DNA的应用,可以尝试用10μL洗脱。
5. 关于DNA片段大小: 该试剂盒适用于100bp - 10kb的片段。对于非常小的片段(如<100bp的引物二聚体),在高盐条件下结合效率较低,因此可以被有效去除。对于非常大的片段(>10kb),结合和洗脱效率会下降,需酌情增加结合和洗脱时间。
五、 下游应用
纯化后的DNA适用于:
Sanger测序
限制性内切酶消化
连接与克隆
体外转录/翻译
下一代测序(NGS)文库构建等。
六、常见问题排查
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